两者同属履约类担保，但用途、责任、时点完全不同。预付款保函担保 “收到预付款后会干活、不跑路、不挪用”，责任是退还预付款；履约保函担保 “按合同保质、保量、按期完成义务”，责任是赔偿违约损失。

触发赔付条件不同：预付款保函在未开工、停工违约、拒不履行时索赔；履约保函在工期延误、质量不达标、交付不合格时索赔。金额不同：预付款保函通常等于预付款金额，履约保函多为合同总额一定比例。期限不同：预付款保函随进度抵扣、完工后失效；履约保函覆盖整个履约期 + 质保期（常见）。实务中，项目通常先开投标保函，中标后开预付款保函 + 履约保函，验收后开质保保函。企业应根据合同节点匹配对应保函，避免错用导致保障不足或成本增加。